Nace el 7 de Febrero de 1956, y a partir de los 9 años comienza a tocar guitarra clásica, a los 12 tiene su primera guitarra eléctrica y realiza su debut profesional en el año 1973, a los 17 años, nada menos que con Pappo´s Blues. A partir de allí participa en Engranaje, Avalancha (graba un single), Carolina y Studebaker.

Entre 1977 y 1984 se radica en Madrid (España) donde integra y graba con diversos músicos y bandas: Cucharada, Joaquín Sabina, Antonio Flores, Mariscal Romero, Pappo, Micky, Ramoncín, Kevin Ayers, Whisky David y Ciro Fogliata.

A su vuelta a Argentina forma Durazno de Gala (graban "Algún Viejo Blues", "Banda de Garaje", "Asuntos de Blues", "Noche de Blues", "Sacále el Jugo", "Una Vieja Historia", y "Piratas"). Paralelamente integra las bandas de Rinaldo Rafanelli, Miguel Cantilo, Vitico, Pappo´s Blues, Las Blacanblus, Los Guarros, Javier Calamaro.

En 1995 Botafogo emprende su carrera solista, que ya cuenta con cinco producciones discográficas y seis métodos de enseñanza de guitarra.

Miguel Botafogo es el mayor representante Argentino del genero del Blues, que más ha viajado en el exterior y en el interior, realizando giras anuales en EEUU desde 1997 a la fecha; Japón en 1999, 2000, 2001 y 2002; Australia en 2001; Austria en 2002; Brasil en 2001; Uruguay en 2001.

En Chile se ha realizado las siguientes presentaciones:
- 2001: 2 shows, más su incursión en el Estadio Nacional como acto de apertura de Eric Clapton.
- Mayo 2002 en The House of Rock & Blues de Santiago y Viña del Mar.
- Junio 2003 nuevamente en The House of Rock & Blues de Viña del Mar y en Aula Magna Universidad Austral de Chile de Valdivia.
- Agosto 2004 Gira Botafogo que incluye las ciudades de Valdivia, Puerto Montt y Santiago

Tanto con Pappo, con Durazno de Gala, o Botafogo solista, realizó actuaciones como soporte de B. B. King (en sus presentaciones en Argentina 1991,1992, 1993, 1994, y 1995); James Cotton (1993); Guns & Roses (1993); Carlos Santana (1993); Buddy Guy (1995); Scott Henderson (1998);Jeff Beck (1998) y Eric Clapton (2001). Grabó junto a Taj Mahal (1994). Actuó como músico de Deacon Jones y de Johnny Rivers (en el canal 13 para Badia y Compañía).

Botafogo enseña guitarra, composición y armonía en la especialidad de Blues y Rock. Ha dado clínicas en el Centro Cultural Ricardo Rojas de la UBA, en Promúsica y en Mannys. Escribió artículos para la revista El Musiquero.

A lo largo de un año y medio (1997/8), fue conductor del programa para televisión, Clínica 21, emitido por Music 21.

En 1995 la empresa Gibson, a través de Importmusic, le regala una guitarra Gibson 135 en honor a su trayectoria.

Botafogo es endorser de las guitarras Fender, y de las guitarra Wesley, para Wesley Guitars de Australia, las cuerdas Magma para Carlos Medina Artigas, los equipos Nativo para Rock Center, los cables KW, y las púas Habeshian.

En 1999 el Diario Clarín premia a Miguel Botafogo como el mejor solista de 1999, en el rubro Jazz y Blues.